ERROR XSDG2: Invalid checksum on Page Page(0,Container(0, 1313))

[David Sitsky-2]

I have an intensive data-processing application which utilises Apache
Lucene and Derby, using 6 quad-core machines running Vista SP1 and/or
Vista Server 2008.

I have found after 5 or 10 hours of processing, one or a couple of my
worker processes start reporting the following error in the derby.log file:

ERROR XSDG2: Invalid checksum on Page Page(0,Container(0, 1313))

The worker process never seems to recover.  Derby locates the error,
reboots the database, but seems to inevitably report the same error
again.  It is always page 1313, and what is extra strange is it doesn't
matter which machine it occurs on, it is always page 1313!  I know 13 is
unlikely, but twice is a row must be extra unlucky. :)

The quad-core machines have been configured with both hardware and
software raid, but the same error has been seen.  Windows does not
report any disk errors in the event log.

The error is difficult to reproduce.  My runs typically run for 24
hours, involving 22 separate JVM processes spread across the machines,
each running their own Derby embedded database.  Sometimes I can get
through the run without any issues - sometimes I might see one or two
processes with this issue, and it seems to pick a different quad-core
machine each time, so the possibility of a hardware error seems like
unlikely, especially given it is always page 1313.

I have tried both 10.3.1.4 and 10.3.2.1 with the same results.

Lucene doesn't report any problems with its index, so given all the
above evidence, I am starting to lean more to a software issue than
hardware.

I have attached three derby.log files from different machines.  Does
anyone have any ideas what might be causing this?

--
Cheers,
David

Nuix Pty Ltd
Suite 79, 89 Jones St, Ultimo NSW 2007, Australia    Ph: [phone]
Web: http://www.nuix.com                            Fax: [phone]

----------------------------------------------------------------
2008-03-27 05:32:33.003 GMT:
 Booting Derby version The Apache Software Foundation - Apache Derby - 10.3.1.4 - (exported): instance c013800d-0118-eeb9-210d-ffff938d2c8d
on database directory D:\temp\c14054ffc067419cb2f8a8071a6b25eb\Partial-82f0f71fb158459fa2df2554fa40fe0b\Stores\EvidenceDatabase  

Database Class Loader started - derby.database.classpath=''

------------  BEGIN SHUTDOWN ERROR STACK -------------

ERROR XSDG2: Invalid checksum on Page Page(0,Container(0, 1313)), expected=125,069,685, on-disk version=218,466,641, page dump follows: Hex dump:
00000000: 0076 0000 0001 0000 0000 0000 27ea 0000  .v..............
00000010: 0000 0006 0000 0000 0000 0000 0000 0000  ................
00000020: 0000 0000 0001 0000 0000 0000 0000 0000  ................
00000030: 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000  ................
00000040: 0000 27e9 0000 0000 0000 27e9 0000 0000  ................
00000050: 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000  ................
00000060: 0000 0000 0000 0000 0000 0000 5000 0000  ............P...
00000070: 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000  ................
00000080: 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000  ................
00000090: 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000  ................
000000a0: 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000  ................
000000b0: 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000  ................
000000c0: 0000 0010 0000 0000 0000 0000 0076 0000  .............v..
000000d0: 0001 0000 0000 0000 27ea 0000 0000 0006  ................
000000e0: 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000  ................
000000f0: 0001 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000  ................
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00000130: 0000 0000 0000 0000 5000 0000 7400 0000  ........P...t...
00000140: 0800 0010 0000 0000 0000 0000 0100 0100  ................
00000150: 0800 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000  ................
00000160: 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0cb5  ...............?
00000170: 5a00 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000  Z...............
00000180: 0000 0000 008c 1672 9a00 0000 0000 0010  .....?.r?.......
00000190: 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000  ................
000001a0: 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000  ................
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000001f0: 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000  ................
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00000240: 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000  ................
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000002a0: 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000  ................
000002b0: 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000  ................
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000002d0: 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000  ................
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000003e0: 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000  ................
000003f0: 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000  ................
00000400: 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000  ................
00000410: 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000  ................
00000420: 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000  ................
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00000470: 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000  ................
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00000550: 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000  ................
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000005a0: 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000  ................
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000005c0: 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000  ................
000005d0: 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000  ................
000005e0: 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000  ................
000005f0: 0000 0000 0000 0000 27e8 8000 0000 0000  ..........?.....
00000600: 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000  ................
00000610: 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000  ................
00000620: 0001 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000  ................
00000630: 0000 8000 0000 0000 0000 0000 0000 0000  ..?.............
00000640: 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000  ................
00000650: 0000 0000 0000 0000 0020 0000 0000 0000  ................
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00000670: 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000  ................
00000680: 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000  ................
00000690: 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000  ................
000006a0: 0000 0000 0000 0000 0002 0800 0000 0000  ................
000006b0: 0000 0000 8000 0000 0000 0000 8000 0000  ....?.......?...
000006c0: 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000  ................
000006d0: 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000  ................
000006e0: 0000 0000 0000 0001 0000 0000 0000 8040  ..............?.
000006f0: 0000 0000 1000 0000 0000 0000 0000 0000  ................
00000700: 0000 0100 0000 0000 0002 0000 2400 0000  ................
00000710: 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000  ................
00000720: 0000 0040 0000 0000 0000 0000 0000 0000  ................
00000730: 0000 0000 0000 0000 0000 4000 0000 8000  ..............?.
00000740: 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000  ................
00000750: 0000 0000 0000 0040 0000 0004 0000 0000  ................
00000760: 0000 0000 0000 0008 0000 0000 0000 0000  ................
00000770: 0002 0000 0000 0000 0000 0000 0004 0000  ................
00000780: 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0020  ................
00000790: 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000  ................
000007a0: 0000 0000 1000 0000 0000 0000 0000 0000  ................
000007b0: 0000 0000 2000 0000 0000 0000 0000 0000  ................
000007c0: 0000 0000 0000 0000 0000 0000 8000 0000  ............?...
000007d0: 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000  ................
000007e0: 0000 0000 0000 0002 0000 0000 0000 0000  ................
000007f0: 0000 0000 0000 0008 0000 0000 0000 1000  ................
00000800: 0001 0400 0000 0000 0000 0800 0000 0000  ................
00000810: 0002 2000 0000 0000 0000 0002 0000 0000  ................
00000820: 0000 0000 0000 0000 0020 0000 0040 0000  ................
00000830: 0000 0002 0000 2000 0000 0000 0000 0000  ................
00000840: 0000 0200 0000 0000 0020 0000 0000 0000  ................
00000850: 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0010  ................
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        at org.apache.activemq.ActiveMQSessionExecutor.iterate(ActiveMQSessionExecutor.java:192)
        at org.apache.activemq.thread.DedicatedTaskRunner.runTask(DedicatedTaskRunner.java:98)
        at org.apache.activemq.thread.DedicatedTaskRunner$1.run(DedicatedTaskRunner.java:36)


------------  END SHUTDOWN ERROR STACK -------------

2008-03-27 10:57:23.425 GMT Thread[ActiveMQ Session: ID:WORKER0-51924-1206595952316-0:1:1,7,main] (XID = 1761307), (SESSIONID = 0), (DATABASE = D:\temp\c14054ffc067419cb2f8a8071a6b25eb\Partial-82f0f71fb158459fa2df2554fa40fe0b\Stores\EvidenceDatabase), (DRDAID = null), Cleanup action starting
2008-03-27 10:57:23.425 GMT Thread[ActiveMQ Session: ID:WORKER0-51924-1206595952316-0:1:1,7,main] (XID = 1761307), (SESSIONID = 0), (DATABASE = D:\temp\c14054ffc067419cb2f8a8071a6b25eb\Partial-82f0f71fb158459fa2df2554fa40fe0b\Stores\EvidenceDatabase), (DRDAID = null), Failed Statement is: INSERT INTO text_table (guidhigh, guid, data) VALUES (?, ?, ?) with 3 parameters begin parameter #1: -748940265630185160 :end parameter begin parameter #2: -6059445367827287599 :end parameter begin parameter #3: BLOB(org.apache.derby.iapi.types.RawToBinaryFormatStream@4f2801) :end parameter
ERROR XSDG2: Invalid checksum on Page Page(0,Container(0, 1313)), expected=125,069,685, on-disk version=218,466,641, page dump follows: Hex dump:
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2008-03-27 10:57:23.425 GMT:
Shutting down instance c013800d-0118-eeb9-210d-ffff938d2c8d
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2008-03-27 10:57:23.425 GMT Thread[ActiveMQ Session: ID:WORKER0-51924-1206595952316-0:1:1,7,main] Less severe exception raised during cleanup (ignored) An attempt was made to close a transaction that was still active. The transaction has been aborted.
ERROR 40XT4: An attempt was made to close a transaction that was still active. The transaction has been aborted.
        at org.apache.derby.iapi.error.StandardException.newException(StandardException.java:280)
        at org.apache.derby.impl.store.raw.xact.Xact.close(Xact.java:1120)
        at org.apache.derby.impl.store.raw.xact.XactContext.cleanupOnError(XactContext.java:140)
        at org.apache.derby.iapi.services.context.ContextManager.cleanupOnError(ContextManager.java:327)
        at org.apache.derby.impl.jdbc.TransactionResourceImpl.cleanupOnError(TransactionResourceImpl.java:419)
        at org.apache.derby.impl.jdbc.TransactionResourceImpl.handleException(TransactionResourceImpl.java:337)
        at org.apache.derby.impl.jdbc.EmbedConnection.handleException(EmbedConnection.java:1572)
        at org.apache.derby.impl.jdbc.ConnectionChild.handleException(ConnectionChild.java:81)
        at org.apache.derby.impl.jdbc.EmbedStatement.executeStatement(EmbedStatement.java:1293)
        at org.apache.derby.impl.jdbc.EmbedPreparedStatement.executeStatement(EmbedPreparedStatement.java:1652)
        at org.apache.derby.impl.jdbc.EmbedPreparedStatement.execute(EmbedPreparedStatement.java:1304)
        at j.a(SourceFile:184)
        at j.a(SourceFile:172)
        at xO.a(SourceFile:119)
        at qe.a(SourceFile:176)
        at xO.b(SourceFile:74)
        at hZ.a(SourceFile:171)
        at nO.a(SourceFile:71)
        at zP.a(SourceFile:65)
        at qS.a(SourceFile:73)
        at com.nuix.processor.jms.Worker.a(SourceFile:1055)
        at com.nuix.processor.jms.Worker.a(SourceFile:661)
        at com.nuix.processor.jms.Worker.onMessage(SourceFile:824)
        at org.apache.activemq.ActiveMQMessageConsumer.dispatch(ActiveMQMessageConsumer.java:960)
        at org.apache.activemq.ActiveMQSessionExecutor.dispatch(ActiveMQSessionExecutor.java:122)
        at org.apache.activemq.ActiveMQSessionExecutor.iterate(ActiveMQSessionExecutor.java:192)
        at org.apache.activemq.thread.DedicatedTaskRunner.runTask(DedicatedTaskRunner.java:98)
        at org.apache.activemq.thread.DedicatedTaskRunner$1.run(DedicatedTaskRunner.java:36)
Cleanup action completed
----------------------------------------------------------------
2008-03-27 10:57:23.472 GMT:
 Booting Derby version The Apache Software Foundation - Apache Derby - 10.3.1.4 - (exported): instance a0200101-0118-eeb9-210d-ffff938d2c8d
on database directory D:\temp\c14054ffc067419cb2f8a8071a6b25eb\Partial-82f0f71fb158459fa2df2554fa40fe0b\Stores\EvidenceDatabase  

Database Class Loader started - derby.database.classpath=''

------------  BEGIN SHUTDOWN ERROR STACK -------------

ERROR XSDG2: Invalid checksum on Page Page(0,Container(0, 1313)), expected=125,069,685, on-disk version=218,466,641, page dump follows: Hex dump:
00000000: 0076 0000 0001 0000 0000 0000 27ea 0000  .v..............
00000010: 0000 0006 0000 0000 0000 0000 0000 0000  ................
00000020: 0000 0000 0001 0000 0000 0000 0000 0000  ................
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00000060: 0000 0000 0000 0000 0000 0000 5000 0000  ............P...
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000000d0: 0001 0000 0000 0000 27ea 0000 0000 0006  ................
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00000140: 0800 0010 0000 0000 0000 0000 0100 0100  ................
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00000160: 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0cb5  ...............?
00000170: 5a00 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000  Z...............
00000180: 0000 0000 008c 1672 9a00 0000 0000 0010  .....?.r?.......
00000190: 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000  ................
000001a0: 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000  ................
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        at org.apache.derby.impl.jdbc.EmbedConnection.prepareStatement(EmbedConnection.java:922)
        at org.apache.derby.impl.jdbc.EmbedConnection.prepareStatement(EmbedConnection.java:750)
        at org.apache.derby.iapi.jdbc.BrokeredConnection.prepareStatement(BrokeredConnection.java:114)
        at j.a(SourceFile:177)
        at j.a(SourceFile:172)
        at xO.a(SourceFile:119)
        at qe.a(SourceFile:176)
        at xO.b(SourceFile:74)
        at hZ.a(SourceFile:171)
        at nO.a(SourceFile:71)
        at zP.a(SourceFile:65)
        at qS.a(SourceFile:73)
        at com.nuix.processor.jms.Worker.a(SourceFile:1055)
        at com.nuix.processor.jms.Worker.a(SourceFile:661)
        at com.nuix.processor.jms.Worker.onMessage(SourceFile:824)
        at org.apache.activemq.ActiveMQMessageConsumer.dispatch(ActiveMQMessageConsumer.java:960)
        at org.apache.activemq.ActiveMQSessionExecutor.dispatch(ActiveMQSessionExecutor.java:122)
        at org.apache.activemq.ActiveMQSessionExecutor.iterate(ActiveMQSessionExecutor.java:192)
        at org.apache.activemq.thread.DedicatedTaskRunner.runTask(DedicatedTaskRunner.java:98)
        at org.apache.activemq.thread.DedicatedTaskRunner$1.run(DedicatedTaskRunner.java:36)


------------  END SHUTDOWN ERROR STACK -------------

----------------------------------------------------------------
2008-03-29 04:29:38.238 GMT:
 Booting Derby version The Apache Software Foundation - Apache Derby - 10.3.2.1 - (599110): instance c013800d-0118-f8cc-3fc1-ffff938d2c8d
on database directory D:\temp\7db256a4a589431eade0f361b792569f\Partial-6674f156474244cfac81b9ef0499b34f\Stores\EvidenceDatabase  

Database Class Loader started - derby.database.classpath=''

------------  BEGIN SHUTDOWN ERROR STACK -------------

ERROR XSDG2: Invalid checksum on Page Page(0,Container(0, 1313)), expected=3,244,997,637, on-disk version=4,190,978,369, page dump follows: Hex dump:
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        at com.nuix.processor.jms.Worker.a(SourceFile:661)
        at com.nuix.processor.jms.Worker.onMessage(SourceFile:824)
        at org.apache.activemq.ActiveMQMessageConsumer.dispatch(ActiveMQMessageConsumer.java:960)
        at org.apache.activemq.ActiveMQSessionExecutor.dispatch(ActiveMQSessionExecutor.java:122)
        at org.apache.activemq.ActiveMQSessionExecutor.iterate(ActiveMQSessionExecutor.java:192)
        at org.apache.activemq.thread.DedicatedTaskRunner.runTask(DedicatedTaskRunner.java:98)
        at org.apache.activemq.thread.DedicatedTaskRunner$1.run(DedicatedTaskRunner.java:36)


------------  END SHUTDOWN ERROR STACK -------------

2008-03-29 16:44:50.095 GMT Thread[ActiveMQ Session: ID:WORKER3-51388-1206764977240-0:1:1,7,main] (XID = 2871296), (SESSIONID = 0), (DATABASE = D:\temp\7db256a4a589431eade0f361b792569f\Partial-6674f156474244cfac81b9ef0499b34f\Stores\EvidenceDatabase), (DRDAID = null), Cleanup action starting
2008-03-29 16:44:50.095 GMT Thread[ActiveMQ Session: ID:WORKER3-51388-1206764977240-0:1:1,7,main] (XID = 2871296), (SESSIONID = 0), (DATABASE = D:\temp\7db256a4a589431eade0f361b792569f\Partial-6674f156474244cfac81b9ef0499b34f\Stores\EvidenceDatabase), (DRDAID = null), Failed Statement is: INSERT INTO text_table (guidhigh, guid, data) VALUES (?, ?, ?) with 3 parameters begin parameter #1: -4257385853364715086 :end parameter begin parameter #2: -6778339853661992218 :end parameter begin parameter #3: BLOB(org.apache.derby.iapi.types.RawToBinaryFormatStream@1fe001) :end parameter
ERROR XSDG2: Invalid checksum on Page Page(0,Container(0, 1313)), expected=3,244,997,637, on-disk version=4,190,978,369, page dump follows: Hex dump:
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        at com.nuix.processor.jms.Worker.onMessage(SourceFile:824)
        at org.apache.activemq.ActiveMQMessageConsumer.dispatch(ActiveMQMessageConsumer.java:960)
        at org.apache.activemq.ActiveMQSessionExecutor.dispatch(ActiveMQSessionExecutor.java:122)
        at org.apache.activemq.ActiveMQSessionExecutor.iterate(ActiveMQSessionExecutor.java:192)
        at org.apache.activemq.thread.DedicatedTaskRunner.runTask(DedicatedTaskRunner.java:98)
        at org.apache.activemq.thread.DedicatedTaskRunner$1.run(DedicatedTaskRunner.java:36)

2008-03-29 16:44:50.095 GMT:
Shutting down instance c013800d-0118-f8cc-3fc1-ffff938d2c8d
----------------------------------------------------------------
Cleanup action completed
----------------------------------------------------------------
2008-03-29 16:44:50.173 GMT:
 Booting Derby version The Apache Software Foundation - Apache Derby - 10.3.2.1 - (599110): instance a0200101-0118-f8cc-3fc1-ffff938d2c8d
on database directory D:\temp\7db256a4a589431eade0f361b792569f\Partial-6674f156474244cfac81b9ef0499b34f\Stores\EvidenceDatabase  

Database Class Loader started - derby.database.classpath=''

------------  BEGIN SHUTDOWN ERROR STACK -------------

ERROR XSDG2: Invalid checksum on Page Page(0,Container(0, 1313)), expected=3,244,997,637, on-disk version=4,190,978,369, page dump follows: Hex dump:
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        at org.apache.activemq.thread.DedicatedTaskRunner$1.run(DedicatedTaskRunner.java:36)


------------  END SHUTDOWN ERROR STACK -------------

2008-03-29 16:44:51.124 GMT Thread[ActiveMQ Session: ID:WORKER3-51388-1206764977240-0:1:1,7,main] (XID = 2871300), (SESSIONID = 0), (DATABASE = D:\temp\7db256a4a589431eade0f361b792569f\Partial-6674f156474244cfac81b9ef0499b34f\Stores\EvidenceDatabase), (DRDAID = null), Cleanup action starting
2008-03-29 16:44:51.124 GMT Thread[ActiveMQ Session: ID:WORKER3-51388-1206764977240-0:1:1,7,main] (XID = 2871300), (SESSIONID = 0), (DATABASE = D:\temp\7db256a4a589431eade0f361b792569f\Partial-6674f156474244cfac81b9ef0499b34f\Stores\EvidenceDatabase), (DRDAID = null), Failed Statement is: INSERT INTO text_table (guidhigh, guid, data) VALUES (?, ?, ?)
ERROR XSDG2: Invalid checksum on Page Page(0,Container(0, 1313)), expected=3,244,997,637, on-disk version=4,190,978,369, page dump follows: Hex dump:
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2008-03-29 16:44:51.140 GMT:
 Booting Derby version The Apache Software Foundation - Apache Derby - 10.3.2.1 - (599110): instance f8e18104-0118-f8cc-3fc1-ffff938d2c8d
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Database Class Loader started - derby.database.classpath=''

------------  BEGIN SHUTDOWN ERROR STACK -------------

ERROR XSDG2: Invalid checksum on Page Page(0,Container(0, 1313)), expected=3,244,997,637, on-disk version=4,190,978,369, page dump follows: Hex dump:
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------------  END SHUTDOWN ERROR STACK -------------

2008-03-29 16:44:51.187 GMT Thread[ActiveMQ Session: ID:WORKER3-51388-1206764977240-0:1:1,7,main] (XID = 2871301), (SESSIONID = 0), (DATABASE = D:\temp\7db256a4a589431eade0f361b792569f\Partial-6674f156474244cfac81b9ef0499b34f\Stores\EvidenceDatabase), (DRDAID = null), Cleanup action starting
2008-03-29 16:44:51.187 GMT Thread[ActiveMQ Session: ID:WORKER3-51388-1206764977240-0:1:1,7,main] (XID = 2871301), (SESSIONID = 0), (DATABASE = D:\temp\7db256a4a589431eade0f361b792569f\Partial-6674f156474244cfac81b9ef0499b34f\Stores\EvidenceDatabase), (DRDAID = null), Failed Statement is: SELECT 1 FROM text_table WHERE guidhigh = ? AND guid = ?
ERROR XSDG2: Invalid checksum on Page Page(0,Container(0, 1313)), expected=3,244,997,637, on-disk version=4,190,978,369, page dump follows: Hex dump:
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        at org.apache.activemq.ActiveMQSessionExecutor.iterate(ActiveMQSessionExecutor.java:192)
        at org.apache.activemq.thread.DedicatedTaskRunner.runTask(DedicatedTaskRunner.java:98)
        at org.apache.activemq.thread.DedicatedTaskRunner$1.run(DedicatedTaskRunner.java:36)

2008-03-29 16:44:51.187 GMT:
Shutting down instance f8e18104-0118-f8cc-3fc1-ffff938d2c8d
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Cleanup action completed
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2008-03-29 16:44:51.187 GMT:
 Booting Derby version The Apache Software Foundation - Apache Derby - 10.3.2.1 - (599110): instance 01a54107-0118-f8cc-3fc1-ffff938d2c8d
on database directory D:\temp\7db256a4a589431eade0f361b792569f\Partial-6674f156474244cfac81b9ef0499b34f\Stores\EvidenceDatabase  

Database Class Loader started - derby.database.classpath=''

------------  BEGIN SHUTDOWN ERROR STACK -------------

ERROR XSDG2: Invalid checksum on Page Page(0,Container(0, 1313)), expected=3,244,997,637, on-disk version=4,190,978,369, page dump follows: Hex dump:
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        at org.apache.activemq.ActiveMQMessageConsumer.dispatch(ActiveMQMessageConsumer.java:960)
        at org.apache.activemq.ActiveMQSessionExecutor.dispatch(ActiveMQSessionExecutor.java:122)
        at org.apache.activemq.ActiveMQSessionExecutor.iterate(ActiveMQSessionExecutor.java:192)
        at org.apache.activemq.thread.DedicatedTaskRunner.runTask(DedicatedTaskRunner.java:98)
        at org.apache.activemq.thread.DedicatedTaskRunner$1.run(DedicatedTaskRunner.java:36)


------------  END SHUTDOWN ERROR STACK -------------

2008-03-29 16:44:51.233 GMT Thread[ActiveMQ Session: ID:WORKER3-51388-1206764977240-0:1:1,7,main] (XID = 2871302), (SESSIONID = 0), (DATABASE = D:\temp\7db256a4a589431eade0f361b792569f\Partial-6674f156474244cfac81b9ef0499b34f\Stores\EvidenceDatabase), (DRDAID = null), Cleanup action starting
2008-03-29 16:44:51.233 GMT Thread[ActiveMQ Session: ID:WORKER3-51388-1206764977240-0:1:1,7,main] (XID = 2871302), (SESSIONID = 0), (DATABASE = D:\temp\7db256a4a589431eade0f361b792569f\Partial-6674f156474244cfac81b9ef0499b34f\Stores\EvidenceDatabase), (DRDAID = null), Failed Statement is: SELECT 1 FROM text_table WHERE guidhigh = ? AND guid = ?
ERROR XSDG2: Invalid checksum on Page Page(0,Container(0, 1313)), expected=3,244,997,637, on-disk version=4,190,978,369, page dump follows: Hex dump:
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        at com.nuix.processor.jms.Worker.a(SourceFile:1118)
        at com.nuix.processor.jms.Worker.a(SourceFile:1118)
        at com.nuix.processor.jms.Worker.a(SourceFile:661)
        at com.nuix.processor.jms.Worker.onMessage(SourceFile:824)
        at org.apache.activemq.ActiveMQMessageConsumer.dispatch(ActiveMQMessageConsumer.java:960)
        at org.apache.activemq.ActiveMQSessionExecutor.dispatch(ActiveMQSessionExecutor.java:122)
        at org.apache.activemq.ActiveMQSessionExecutor.iterate(ActiveMQSessionExecutor.java:192)
        at org.apache.activemq.thread.DedicatedTaskRunner.runTask(DedicatedTaskRunner.java:98)
        at org.apache.activemq.thread.DedicatedTaskRunner$1.run(DedicatedTaskRunner.java:36)

2008-03-29 16:44:51.233 GMT:
Shutting down instance 01a54107-0118-f8cc-3fc1-ffff938d2c8d
----------------------------------------------------------------
Cleanup action completed
----------------------------------------------------------------

----------------------------------------------------------------
2008-03-20 20:33:46.484 GMT:
 Booting Derby version The Apache Software Foundation - Apache Derby - 10.3.1.4 - (exported): instance c013800d-0118-cde5-b578-ffff938d2c8d
on database directory D:\temp\a1e5982586fd4174945d17b134a52868\Partial-d029660235b64e079e9c35907478b9f5\Stores\EvidenceDatabase  

Database Class Loader started - derby.database.classpath=''
2008-03-22 13:00:53.530 GMT Thread[ActiveMQ Session: ID:WORKER4-49200-1206045225564-0:1:1,7,main] (XID = 7387738), (SESSIONID = 0), (DATABASE = D:\temp\a1e5982586fd4174945d17b134a52868\Partial-d029660235b64e079e9c35907478b9f5\Stores\EvidenceDatabase), (DRDAID = null), Cleanup action starting
2008-03-22 13:00:53.530 GMT Thread[ActiveMQ Session: ID:WORKER4-49200-1206045225564-0:1:1,7,main] (XID = 7387738), (SESSIONID = 0), (DATABASE = D:\temp\a1e5982586fd4174945d17b134a52868\Partial-d029660235b64e079e9c35907478b9f5\Stores\EvidenceDatabase), (DRDAID = null), Failed Statement is: SELECT 1 FROM text_table WHERE guidhigh = ? AND guid = ? with 2 parameters begin parameter #1: 5913497879417998584 :end parameter begin parameter #2: -4964133927589897714 :end parameter
org.apache.derby.shared.common.sanity.AssertFailure: ASSERT FAILED
        at org.apache.derby.shared.common.sanity.SanityManager.ASSERT(SanityManager.java:98)
        at org.apache.derby.impl.store.access.btree.ControlRow.getControlRowForPage(ControlRow.java:883)
        at org.apache.derby.impl.store.access.btree.ControlRow.get(ControlRow.java:844)
        at org.apache.derby.impl.store.access.btree.ControlRow.get(ControlRow.java:820)
        at org.apache.derby.impl.store.access.btree.BranchControlRow.getChildPageAtSlot(BranchControlRow.java:1423)
        at org.apache.derby.impl.store.access.btree.BranchControlRow.search(BranchControlRow.java:284)
        at org.apache.derby.impl.store.access.btree.BranchControlRow.search(BranchControlRow.java:291)
        at org.apache.derby.impl.store.access.btree.BranchControlRow.search(BranchControlRow.java:291)
        at org.apache.derby.impl.store.access.btree.BTreeScan.positionAtStartForForwardScan(BTreeScan.java:395)
        at org.apache.derby.impl.store.access.btree.BTreeForwardScan.positionAtStartPosition(BTreeForwardScan.java:71)
        at org.apache.derby.impl.store.access.btree.BTreeForwardScan.fetchRows(BTreeForwardScan.java:123)
        at org.apache.derby.impl.store.access.btree.BTreeScan.fetchNext(BTreeScan.java:1794)
        at org.apache.derby.impl.sql.execute.TableScanResultSet.getNextRowCore(TableScanResultSet.java:688)
        at org.apache.derby.impl.sql.execute.ProjectRestrictResultSet.getNextRowCore(ProjectRestrictResultSet.java:255)
        at org.apache.derby.impl.sql.execute.BasicNoPutResultSetImpl.getNextRow(BasicNoPutResultSetImpl.java:475)
        at org.apache.derby.impl.jdbc.EmbedResultSet.movePosition(EmbedResultSet.java:443)
        at org.apache.derby.impl.jdbc.EmbedResultSet.next(EmbedResultSet.java:387)
        at k.a(SourceFile:143)
        at k.a(SourceFile:129)
        at xO.a(SourceFile:119)
        at qe.a(SourceFile:176)
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        at nO.a(SourceFile:59)
        at zP.a(SourceFile:51)
        at qS.a(SourceFile:65)
        at com.nuix.processor.jms.Worker.a(SourceFile:1055)
        at com.nuix.processor.jms.Worker.a(SourceFile:1118)
        at com.nuix.processor.jms.Worker.a(SourceFile:1118)
        at com.nuix.processor.jms.Worker.a(SourceFile:1118)
        at com.nuix.processor.jms.Worker.a(SourceFile:1118)
        at com.nuix.processor.jms.Worker.a(SourceFile:1118)
        at com.nuix.processor.jms.Worker.a(SourceFile:1118)
        at com.nuix.processor.jms.Worker.a(SourceFile:1118)
        at com.nuix.processor.jms.Worker.a(SourceFile:1118)
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        at com.nuix.processor.jms.Worker.a(SourceFile:1118)
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        at com.nuix.processor.jms.Worker.onMessage(SourceFile:824)
        at org.apache.activemq.ActiveMQMessageConsumer.dispatch(ActiveMQMessageConsumer.java:960)
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        at org.apache.activemq.thread.DedicatedTaskRunner$1.run(DedicatedTaskRunner.java:36)
Cleanup action completed
2008-03-22 13:00:53.561 GMT Thread[ActiveMQ Session: ID:WORKER4-49200-1206045225564-0:1:1,7,main] (XID = 7387740), (SESSIONID = 1), (DATABASE = D:\temp\a1e5982586fd4174945d17b134a52868\Partial-d029660235b64e079e9c35907478b9f5\Stores\EvidenceDatabase), (DRDAID = null), Cleanup action starting
2008-03-22 13:00:53.561 GMT Thread[ActiveMQ Session: ID:WORKER4-49200-1206045225564-0:1:1,7,main] (XID = 7387740), (SESSIONID = 1), (DATABASE = D:\temp\a1e5982586fd4174945d17b134a52868\Partial-d029660235b64e079e9c35907478b9f5\Stores\EvidenceDatabase), (DRDAID = null), Failed Statement is: SELECT 1 FROM text_table WHERE guidhigh = ? AND guid = ? with 2 parameters begin parameter #1: 5913497879417998584 :end parameter begin parameter #2: -4964133927589897714 :end parameter
org.apache.derby.shared.common.sanity.AssertFailure: ASSERT FAILED
        at org.apache.derby.shared.common.sanity.SanityManager.ASSERT(SanityManager.java:98)
        at org.apache.derby.impl.store.access.btree.ControlRow.getControlRowForPage(ControlRow.java:883)
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        at org.apache.derby.impl.store.access.btree.BranchControlRow.search(BranchControlRow.java:284)
        at org.apache.derby.impl.store.access.btree.BranchControlRow.search(BranchControlRow.java:291)
        at org.apache.derby.impl.store.access.btree.BranchControlRow.search(BranchControlRow.java:291)
        at org.apache.derby.impl.store.access.btree.BTreeScan.positionAtStartForForwardScan(BTreeScan.java:395)
        at org.apache.derby.impl.store.access.btree.BTreeForwardScan.positionAtStartPosition(BTreeForwardScan.java:71)
        at org.apache.derby.impl.store.access.btree.BTreeForwardScan.fetchRows(BTreeForwardScan.java:123)
        at org.apache.derby.impl.store.access.btree.BTreeScan.fetchNext(BTreeScan.java:1794)
        at org.apache.derby.impl.sql.execute.TableScanResultSet.getNextRowCore(TableScanResultSet.java:688)
        at org.apache.derby.impl.sql.execute.ProjectRestrictResultSet.getNextRowCore(ProjectRestrictResultSet.java:255)
        at org.apache.derby.impl.sql.execute.BasicNoPutResultSetImpl.getNextRow(BasicNoPutResultSetImpl.java:475)
        at org.apache.derby.impl.jdbc.EmbedResultSet.movePosition(EmbedResultSet.java:443)
        at org.apache.derby.impl.jdbc.EmbedResultSet.next(EmbedResultSet.java:387)
        at k.a(SourceFile:143)
        at k.a(SourceFile:129)
        at xO.a(SourceFile:119)
        at qe.a(SourceFile:176)
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        at qS.a(SourceFile:65)
        at com.nuix.processor.jms.Worker.a(SourceFile:1055)
        at com.nuix.processor.jms.Worker.a(SourceFile:1118)
        at com.nuix.processor.jms.Worker.a(SourceFile:1118)
        at com.nuix.processor.jms.Worker.a(SourceFile:1118)
        at com.nuix.processor.jms.Worker.a(SourceFile:1118)
        at com.nuix.processor.jms.Worker.a(SourceFile:1118)
        at com.nuix.processor.jms.Worker.a(SourceFile:1118)
        at com.nuix.processor.jms.Worker.a(SourceFile:1118)
        at com.nuix.processor.jms.Worker.a(SourceFile:1118)
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Cleanup action completed
2008-03-22 13:00:53.576 GMT Thread[ActiveMQ Session: ID:WORKER4-49200-1206045225564-0:1:1,7,main] (XID = 7387742), (SESSIONID = 2), (DATABASE = D:\temp\a1e5982586fd4174945d17b134a52868\Partial-d029660235b64e079e9c35907478b9f5\Stores\EvidenceDatabase), (DRDAID = null), Cleanup action starting
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Cleanup action completed

------------  BEGIN SHUTDOWN ERROR STACK -------------

ERROR XSDG2: Invalid checksum on Page Page(0,Container(0, 1313)), expected=1,660,073,193, on-disk version=809,618,054, page dump follows: Hex dump:
00000000: 0076 0000 0001 0000 0000 0000 27ea 0000  .v..............
00000010: 0000 0006 0000 0000 0000 0000 0000 0000  ................
00000020: 0000 0000 0001 0000 0000 0000 0000 0000  ................
00000030: 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000  ................
00000040: 0000 27e9 0000 0000 0000 27e9 0000 0000  ................
00000050: 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000  ................
00000060: 0000 0000 0000 0000 0000 0000 5000 0000  ............P...
00000070: 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000  ................
00000080: 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000  ................
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000000b0: 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000  ................
000000c0: 0000 0010 0000 0000 0000 0000 0076 0000  .............v..
000000d0: 0001 0000 0000 0000 27ea 0000 0000 0006  ................
000000e0: 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000  ................
000000f0: 0001 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000  ................
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00000120: 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000  ................
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00000140: 0800 0010 0000 0000 0000 0000 0100 0100  ................
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00000170: 7900 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000  y...............
00000180: 0000 0000 002a 7567 6f00 0000 0000 0010  ......ugo.......
00000190: 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000  ................
000001a0: 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000  ................
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------------  END SHUTDOWN ERROR STACK -------------

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2008-03-22 13:55:23.227 GMT Thread[ActiveMQ Session: ID:WORKER4-49200-1206045225564-0:1:1,7,main] (XID = 7528161), (SESSIONID = 3), (DATABASE = D:\temp\a1e5982586fd4174945d17b134a52868\Partial-d029660235b64e079e9c35907478b9f5\Stores\EvidenceDatabase), (DRDAID = null), Failed Statement is: INSERT INTO text_table (guidhigh, guid, data) VALUES (?, ?, ?) with 3 parameters begin parameter #1: -8664309083663678853 :end parameter begin parameter #2: -8452702858001716482 :end parameter begin parameter #3: BLOB(org.apache.derby.iapi.types.RawToBinaryFormatStream@1d3e8eb) :end parameter
ERROR XSDG2: Invalid checksum on Page Page(0,Container(0, 1313)), expected=1,660,073,193, on-disk version=809,618,054, page dump follows: Hex dump:
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00000dd0: 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000  ................
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00000df0: 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000  ................
00000e00: 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000  ................
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00000ea0: 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000  ................
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00000ed0: 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000  ................
00000ee0: 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000  ................
00000ef0: 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000  ................
00000f00: 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000  ................
00000f10: 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000  ................
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00000f40: 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000  ................
00000f50: 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000  ................
00000f60: 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000  ................
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00000fb0: 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000  ................
00000fc0: 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000  ................
00000fd0: 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000  ................
00000fe0: 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000  ................
00000ff0: 0000 0000 0000 0000 0000 0000 3041 ca86  ............0A??

        at org.apache.derby.iapi.error.StandardException.newException(StandardException.java:371)
        at org.apache.derby.impl.store.raw.data.StoredPage.validateChecksum(StoredPage.java:929)
        at org.apache.derby.impl.store.raw.data.StoredPage.initFromData(StoredPage.java:810)
        at org.apache.derby.impl.store.raw.data.AllocPage.initFromData(AllocPage.java:381)
        at org.apache.derby.impl.store.raw.data.CachedPage.setIdentity(CachedPage.java:215)
        at org.apache.derby.impl.store.raw.data.CachedPage.setIdentity(CachedPage.java:210)
        at org.apache.derby.impl.services.cache.CachedItem.takeOnIdentity(CachedItem.java:222)
        at org.apache.derby.impl.services.cache.Clock.addEntry(Clock.java:800)
        at org.apache.derby.impl.services.cache.Clock.find(Clock.java:303)
        at org.apache.derby.impl.store.raw.data.FileContainer.getAllocPage(FileContainer.java:2669)
        at org.apache.derby.impl.store.raw.data.BaseContainer.getAllocPage(BaseContainer.java:486)
        at org.apache.derby.impl.store.raw.data.BaseContainerHandle.getAllocPage(BaseContainerHandle.java:327)
        at org.apache.derby.impl.store.raw.data.FileContainer.findAllocPageForAdd(FileContainer.java:2054)
        at org.apache.derby.impl.store.raw.data.FileContainer.newPage(FileContainer.java:1601)
        at org.apache.derby.impl.store.raw.data.BaseContainer.addPage(BaseContainer.java:314)
        at org.apache.derby.impl.store.raw.data.BaseContainerHandle.addPage(BaseContainerHandle.java:183)
        at org.apache.derby.impl.store.access.btree.LeafControlRow.allocate(LeafControlRow.java:123)
        at org.apache.derby.impl.store.access.btree.LeafControlRow.splitFor(LeafControlRow.java:666)
        at org.apache.derby.impl.store.access.btree.BranchControlRow.splitFor(BranchControlRow.java:907)
        at org.apache.derby.impl.store.access.btree.BranchControlRow.splitFor(BranchControlRow.java:907)
        at org.apache.derby.impl.store.access.btree.BranchControlRow.splitFor(BranchControlRow.java:907)
        at org.apache.derby.impl.store.access.btree.BTreeController.start_xact_and_dosplit(BTreeController.java:339)
        at org.apache.derby.impl.store.access.btree.BTreeController.doIns(BTreeController.java:672)
        at org.apache.derby.impl.store.access.btree.BTreeController.insert(BTreeController.java:1035)
        at org.apache.derby.impl.store.access.btree.index.B2IController.insert(B2IController.java:211)
        at org.apache.derby.impl.sql.execute.IndexChanger.insertAndCheckDups(IndexChanger.java:455)
        at org.apache.derby.impl.sql.execute.IndexChanger.doInsert(IndexChanger.java:398)
        at org.apache.derby.impl.sql.execute.IndexChanger.insert(IndexChanger.java:605)
        at org.apache.derby.impl.sql.execute.IndexSetChanger.insert(IndexSetChanger.java:268)
        at org.apache.derby.impl.sql.execute.RowChangerImpl.insertRow(RowChangerImpl.java:453)
        at org.apache.derby.impl.sql.execute.InsertResultSet.normalInsertCore(InsertResultSet.java:1024)
        at org.apache.derby.impl.sql.execute.InsertResultSet.open(InsertResultSet.java:497)
        at org.apache.derby.impl.sql.GenericPreparedStatement.execute(GenericPreparedStatement.java:370)
        at org.apache.derby.impl.jdbc.EmbedStatement.executeStatement(EmbedStatement.java:1203)
        at org.apache.derby.impl.jdbc.EmbedPreparedStatement.executeStatement(EmbedPreparedStatement.java:1652)
        at org.apache.derby.impl.jdbc.EmbedPreparedStatement.execute(EmbedPreparedStatement.java:1304)
        at j.a(SourceFile:184)
        at j.a(SourceFile:172)
        at xO.a(SourceFile:119)
        at qe.a(SourceFile:176)
        at xO.b(SourceFile:74)
        at hZ.a(SourceFile:171)
        at nO.a(SourceFile:71)
        at zP.a(SourceFile:65)
        at qS.a(SourceFile:73)
        at com.nuix.processor.jms.Worker.a(SourceFile:1055)
        at com.nuix.processor.jms.Worker.a(SourceFile:1118)
        at com.nuix.processor.jms.Worker.a(SourceFile:1118)
        at com.nuix.processor.jms.Worker.a(SourceFile:661)
        at com.nuix.processor.jms.Worker.onMessage(SourceFile:824)
        at org.apache.activemq.ActiveMQMessageConsumer.dispatch(ActiveMQMessageConsumer.java:960)
        at org.apache.activemq.ActiveMQSessionExecutor.dispatch(ActiveMQSessionExecutor.java:122)
        at org.apache.activemq.ActiveMQSessionExecutor.iterate(ActiveMQSessionExecutor.java:192)
        at org.apache.activemq.thread.DedicatedTaskRunner.runTask(DedicatedTaskRunner.java:98)
        at org.apache.activemq.thread.DedicatedTaskRunner$1.run(DedicatedTaskRunner.java:36)

2008-03-22 13:55:23.227 GMT:
Shutting down instance c013800d-0118-cde5-b578-ffff938d2c8d
----------------------------------------------------------------
2008-03-22 13:55:23.227 GMT Thread[ActiveMQ Session: ID:WORKER4-49200-1206045225564-0:1:1,7,main] Less severe exception raised during cleanup (ignored) An attempt was made to close a transaction that was still active. The transaction has been aborted.
ERROR 40XT4: An attempt was made to close a transaction that was still active. The transaction has been aborted.
        at org.apache.derby.iapi.error.StandardException.newException(StandardException.java:280)
        at org.apache.derby.impl.store.raw.xact.Xact.close(Xact.java:1120)
        at org.apache.derby.impl.store.raw.xact.XactContext.cleanupOnError(XactContext.java:140)
        at org.apache.derby.iapi.services.context.ContextManager.cleanupOnError(ContextManager.java:327)
        at org.apache.derby.impl.jdbc.TransactionResourceImpl.cleanupOnError(TransactionResourceImpl.java:419)
        at org.apache.derby.impl.jdbc.TransactionResourceImpl.handleException(TransactionResourceImpl.java:337)
        at org.apache.derby.impl.jdbc.EmbedConnection.handleException(EmbedConnection.java:1572)
        at org.apache.derby.impl.jdbc.ConnectionChild.handleException(ConnectionChild.java:81)
        at org.apache.derby.impl.jdbc.EmbedStatement.executeStatement(EmbedStatement.java:1293)
        at org.apache.derby.impl.jdbc.EmbedPreparedStatement.executeStatement(EmbedPreparedStatement.java:1652)
        at org.apache.derby.impl.jdbc.EmbedPreparedStatement.execute(EmbedPreparedStatement.java:1304)
        at j.a(SourceFile:184)
        at j.a(SourceFile:172)
        at xO.a(SourceFile:119)
        at qe.a(SourceFile:176)
        at xO.b(SourceFile:74)
        at hZ.a(SourceFile:171)
        at nO.a(SourceFile:71)
        at zP.a(SourceFile:65)
        at qS.a(SourceFile:73)
        at com.nuix.processor.jms.Worker.a(SourceFile:1055)
        at com.nuix.processor.jms.Worker.a(SourceFile:1118)
        at com.nuix.processor.jms.Worker.a(SourceFile:1118)
        at com.nuix.processor.jms.Worker.a(SourceFile:661)
        at com.nuix.processor.jms.Worker.onMessage(SourceFile:824)
        at org.apache.activemq.ActiveMQMessageConsumer.dispatch(ActiveMQMessageConsumer.java:960)
        at org.apache.activemq.ActiveMQSessionExecutor.dispatch(ActiveMQSessionExecutor.java:122)
        at org.apache.activemq.ActiveMQSessionExecutor.iterate(ActiveMQSessionExecutor.java:192)
        at org.apache.activemq.thread.DedicatedTaskRunner.runTask(DedicatedTaskRunner.java:98)
        at org.apache.activemq.thread.DedicatedTaskRunner$1.run(DedicatedTaskRunner.java:36)
Cleanup action completed
----------------------------------------------------------------
2008-03-22 13:55:23.290 GMT:
 Booting Derby version The Apache Software Foundation - Apache Derby - 10.3.1.4 - (exported): instance a0200101-0118-cde5-b578-ffff938d2c8d
on database directory D:\temp\a1e5982586fd4174945d17b134a52868\Partial-d029660235b64e079e9c35907478b9f5\Stores\EvidenceDatabase  

Database Class Loader started - derby.database.classpath=''

------------  BEGIN SHUTDOWN ERROR STACK -------------

[V Narayanan]

Hi David,

You might find the following links containing earlier discussions on the
similar issue useful,

http://www.nabble.com/invalid-checksum-tt9528741.html#a9528741

http://www.nabble.com/Derby-crash-%28urgent%29-tt16217446.html#a16265491

https://issues.apache.org/jira/browse/DERBY-2475

Narayanan

David Sitsky wrote:

> I have an intensive data-processing application which utilises Apache
> Lucene and Derby, using 6 quad-core machines running Vista SP1 and/or
> Vista Server 2008.
>
> I have found after 5 or 10 hours of processing, one or a couple of my
> worker processes start reporting the following error in the derby.log
> file:
>
> ERROR XSDG2: Invalid checksum on Page Page(0,Container(0, 1313))
>
> The worker process never seems to recover.  Derby locates the error,
> reboots the database, but seems to inevitably report the same error
> again.  It is always page 1313, and what is extra strange is it
> doesn't matter which machine it occurs on, it is always page 1313!  I
> know 13 is unlikely, but twice is a row must be extra unlucky. :)
>
> The quad-core machines have been configured with both hardware and
> software raid, but the same error has been seen.  Windows does not
> report any disk errors in the event log.
>
> The error is difficult to reproduce.  My runs typically run for 24
> hours, involving 22 separate JVM processes spread across the machines,
> each running their own Derby embedded database.  Sometimes I can get
> through the run without any issues - sometimes I might see one or two
> processes with this issue, and it seems to pick a different quad-core
> machine each time, so the possibility of a hardware error seems like
> unlikely, especially given it is always page 1313.
>
> I have tried both 10.3.1.4 and 10.3.2.1 with the same results.
>
> Lucene doesn't report any problems with its index, so given all the
> above evidence, I am starting to lean more to a software issue than
> hardware.
>
> I have attached three derby.log files from different machines.  Does
> anyone have any ideas what might be causing this?
>

[David Sitsky-2]

Hi Narayanan,

Yes I have seen those links already.  I have spent quite a bit of time
confirming that my hardware is not at fault before posting here.

I think you'll agree to see exactly the same page number failing on 3
separate machines lends itself more to being a software issue than a
hardware one.

The OS has not reported any disk issues at all.

Cheers,
David

Narayanan wrote:

> Hi David,
>
> You might find the following links containing earlier discussions on the
> similar issue useful,
>
> http://www.nabble.com/invalid-checksum-tt9528741.html#a9528741
>
> http://www.nabble.com/Derby-crash-%28urgent%29-tt16217446.html#a16265491
>
> https://issues.apache.org/jira/browse/DERBY-2475
>
> Narayanan
>
> David Sitsky wrote:
>> I have an intensive data-processing application which utilises Apache
>> Lucene and Derby, using 6 quad-core machines running Vista SP1 and/or
>> Vista Server 2008.
>>
>> I have found after 5 or 10 hours of processing, one or a couple of my
>> worker processes start reporting the following error in the derby.log
>> file:
>>
>> ERROR XSDG2: Invalid checksum on Page Page(0,Container(0, 1313))
>>
>> The worker process never seems to recover.  Derby locates the error,
>> reboots the database, but seems to inevitably report the same error
>> again.  It is always page 1313, and what is extra strange is it
>> doesn't matter which machine it occurs on, it is always page 1313!  I
>> know 13 is unlikely, but twice is a row must be extra unlucky. :)
>>
>> The quad-core machines have been configured with both hardware and
>> software raid, but the same error has been seen.  Windows does not
>> report any disk errors in the event log.
>>
>> The error is difficult to reproduce.  My runs typically run for 24
>> hours, involving 22 separate JVM processes spread across the machines,
>> each running their own Derby embedded database.  Sometimes I can get
>> through the run without any issues - sometimes I might see one or two
>> processes with this issue, and it seems to pick a different quad-core
>> machine each time, so the possibility of a hardware error seems like
>> unlikely, especially given it is always page 1313.
>>
>> I have tried both 10.3.1.4 and 10.3.2.1 with the same results.
>>
>> Lucene doesn't report any problems with its index, so given all the
>> above evidence, I am starting to lean more to a software issue than
>> hardware.
>>
>> I have attached three derby.log files from different machines.  Does
>> anyone have any ideas what might be causing this?
>>

--
Cheers,
David

Nuix Pty Ltd
Suite 79, 89 Jones St, Ultimo NSW 2007, Australia    Ph: [phone]
Web: http://www.nuix.com                            Fax: [phone]

[David Sitsky-2]

For what its worth, I did another run last night on my 6 quad-core
system.  This time I had the derby issue happen for a JVM process on
machine 1, two processes on machine 4, and one on machine 5.  I run four
JVM processes per quad-core machine.

All the JVM processes have roughly the same data processing rate, but
the issue happens at different times into the load.  The problem
occurred around time 420, 480, 800 and 900 minutes into the load for the
four problematic processes.

As is always the case - all of them report the issue on page 1313, and
there are no disk errors reported by Windows.

Any ideas what the problem might be?  I am happy to invest the time to
track down the issue, but I need some guidance from the Derby gurus.

I noticed 1313 in binary is 10100100001.  Does this have special
significance within Derby's binary tree structures?

Cheers,
David

David Sitsky wrote:

> Hi Narayanan,
>
> Yes I have seen those links already.  I have spent quite a bit of time
> confirming that my hardware is not at fault before posting here.
>
> I think you'll agree to see exactly the same page number failing on 3
> separate machines lends itself more to being a software issue than a
> hardware one.
>
> The OS has not reported any disk issues at all.
>
> Cheers,
> David
>
> Narayanan wrote:
>> Hi David,
>>
>> You might find the following links containing earlier discussions on
>> the similar issue useful,
>>
>> http://www.nabble.com/invalid-checksum-tt9528741.html#a9528741
>>
>> http://www.nabble.com/Derby-crash-%28urgent%29-tt16217446.html#a16265491
>>
>> https://issues.apache.org/jira/browse/DERBY-2475
>>
>> Narayanan
>>
>> David Sitsky wrote:
>>> I have an intensive data-processing application which utilises Apache
>>> Lucene and Derby, using 6 quad-core machines running Vista SP1 and/or
>>> Vista Server 2008.
>>>
>>> I have found after 5 or 10 hours of processing, one or a couple of my
>>> worker processes start reporting the following error in the derby.log
>>> file:
>>>
>>> ERROR XSDG2: Invalid checksum on Page Page(0,Container(0, 1313))
>>>
>>> The worker process never seems to recover.  Derby locates the error,
>>> reboots the database, but seems to inevitably report the same error
>>> again.  It is always page 1313, and what is extra strange is it
>>> doesn't matter which machine it occurs on, it is always page 1313!  I
>>> know 13 is unlikely, but twice is a row must be extra unlucky. :)
>>>
>>> The quad-core machines have been configured with both hardware and
>>> software raid, but the same error has been seen.  Windows does not
>>> report any disk errors in the event log.
>>>
>>> The error is difficult to reproduce.  My runs typically run for 24
>>> hours, involving 22 separate JVM processes spread across the
>>> machines, each running their own Derby embedded database.  Sometimes
>>> I can get through the run without any issues - sometimes I might see
>>> one or two processes with this issue, and it seems to pick a
>>> different quad-core machine each time, so the possibility of a
>>> hardware error seems like unlikely, especially given it is always
>>> page 1313.
>>>
>>> I have tried both 10.3.1.4 and 10.3.2.1 with the same results.
>>>
>>> Lucene doesn't report any problems with its index, so given all the
>>> above evidence, I am starting to lean more to a software issue than
>>> hardware.
>>>
>>> I have attached three derby.log files from different machines.  Does
>>> anyone have any ideas what might be causing this?
>>>
>
>

[Stanley Bradbury]

David Sitsky wrote:

> Hi Narayanan,
>
> Yes I have seen those links already.  I have spent quite a bit of time
> confirming that my hardware is not at fault before posting here.
>
> I think you'll agree to see exactly the same page number failing on 3
> separate machines lends itself more to being a software issue than a
> hardware one.
>
> The OS has not reported any disk issues at all.
>
> Cheers,
> David
>
> Narayanan wrote:
>> Hi David,
>>
>> You might find the following links containing earlier discussions on
>> the similar issue useful,
>>
>> http://www.nabble.com/invalid-checksum-tt9528741.html#a9528741
>>
>> http://www.nabble.com/Derby-crash-%28urgent%29-tt16217446.html#a16265491
>>
>> https://issues.apache.org/jira/browse/DERBY-2475
>>
>> Narayanan
>>
>> David Sitsky wrote:
>>> I have an intensive data-processing application which utilises
>>> Apache Lucene and Derby, using 6 quad-core machines running Vista
>>> SP1 and/or Vista Server 2008.
>>>
>>> I have found after 5 or 10 hours of processing, one or a couple of
>>> my worker processes start reporting the following error in the
>>> derby.log file:
>>>
>>> ERROR XSDG2: Invalid checksum on Page Page(0,Container(0, 1313))
>>>
>>> The worker process never seems to recover.  Derby locates the error,
>>> reboots the database, but seems to inevitably report the same error
>>> again.  It is always page 1313, and what is extra strange is it
>>> doesn't matter which machine it occurs on, it is always page 1313!  
>>> I know 13 is unlikely, but twice is a row must be extra unlucky. :)
>>>
>>> The quad-core machines have been configured with both hardware and
>>> software raid, but the same error has been seen.  Windows does not
>>> report any disk errors in the event log.
>>>
>>> The error is difficult to reproduce.  My runs typically run for 24
>>> hours, involving 22 separate JVM processes spread across the
>>> machines, each running their own Derby embedded database.  Sometimes
>>> I can get through the run without any issues - sometimes I might see
>>> one or two processes with this issue, and it seems to pick a
>>> different quad-core machine each time, so the possibility of a
>>> hardware error seems like unlikely, especially given it is always
>>> page 1313.
>>>
>>> I have tried both 10.3.1.4 and 10.3.2.1 with the same results.
>>>
>>> Lucene doesn't report any problems with its index, so given all the
>>> above evidence, I am starting to lean more to a software issue than
>>> hardware.
>>>
>>> I have attached three derby.log files from different machines.  Does
>>> anyone have any ideas what might be causing this?
>>>
>
>

Hi Dave -

The problem is happening on the Page 0 [the first page] of conglomerate
1313 (the conglomerateId) - you can see what table/index this
corresponds to with the following query:

 select CONGLOMERATENUMBER, CONGLOMERATENAME
  from sys.sysconglomerates
  where conglomeratenumber =  1313;

 From the errors in your log I suspect this to be the table or one of
the indexes of the failing query listed:
    INSERT INTO text_table (guidhigh, guid, data)

Does your database reboot without any errors after the shutdown/crash?

You wrote:  " /Derby locates the error, reboots the database, but seems
to inevitably report the same error again./ "

I assume this means you get the same exception when the database reboots
(indicating the change was written to the transaction log and is
replaying the error as the database attempts to recover when the db
reboots).

 From looking at your derby.log files I noted two things that may not be
important but, because you are having trouble you might try changing to
see if it makes any difference:

1) the databases are created in the directory D:\temp...   If you
suspect that this directory is every purged/cleared then this in not a
good place to have database files.  The files should be in a permanent
and secure location.

2) the attempts to reboot the database after is shutdown are almost
instantaneous (well less than a second between the SHUTDOWN timestamp
and the BOOTING timestamp).  I assume the database is being rebooted
within the same JVM and would like to see if adding a pause between
reboots to insure that all objects have been garbage collected changes
anything.   Alternately if you shutdown the system then attempt to
access the database from a newly started JVM ( I would use IJ) and still
get the exception this shows that uncollected derby objects are not the
problem.

Hope this helps.

[David Sitsky-2]

Hi Stanley,

Thanks for your message.

> The problem is happening on the Page 0 [the first page] of conglomerate
> 1313 (the conglomerateId) - you can see what table/index this
> corresponds to with the following query:
>
> select CONGLOMERATENUMBER, CONGLOMERATENAME
>  from sys.sysconglomerates
>  where conglomeratenumber =  1313;
>
>  From the errors in your log I suspect this to be the table or one of
> the indexes of the failing query listed:
>    INSERT INTO text_table (guidhigh, guid, data)

That's correct - there are essentially two types of queries which seem
to cause the issue on the text_table table.  Either the insertion of
blob data into text_table (it is compressed text), or a select call
check for the existence of an entry given guidhigh and guid.

> Does your database reboot without any errors after the shutdown/crash?
>
> You wrote:  " /Derby locates the error, reboots the database, but seems
> to inevitably report the same error again./ "
>
> I assume this means you get the same exception when the database reboots
> (indicating the change was written to the transaction log and is
> replaying the error as the database attempts to recover when the db
> reboots).

That's right.  I just tried explicitly restarting the application by
killing off the process (there is a nanny process which detects this and
automatically restarts it).  However I still get the same derby errors
on startup.

> 1) the databases are created in the directory D:\temp...   If you
> suspect that this directory is every purged/cleared then this in not a
> good place to have database files.  The files should be in a permanent
> and secure location.

In this case the d:\ is a raid array, and even though it is written to a
directory called temp, nothing is being deleted from it.  There are no
virus scanners running either.

> anything.   Alternately if you shutdown the system then attempt to
> access the database from a newly started JVM ( I would use IJ) and still
> get the exception this shows that uncollected derby objects are not the
> problem.

Yes - I have confirmed that restarting the JVM still reports the same
error on startup I am afraid.

Any ideas on what to check for now?

--
Cheers,
David

Nuix Pty Ltd
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[David Sitsky-2]

Hi Stanley,

> The problem is happening on the Page 0 [the first page] of conglomerate
> 1313 (the conglomerateId) - you can see what table/index this
> corresponds to with the following query:
>
> select CONGLOMERATENUMBER, CONGLOMERATENAME
>  from sys.sysconglomerates
>  where conglomeratenumber =  1313;
>
>  From the errors in your log I suspect this to be the table or one of
> the indexes of the failing query listed:
>    INSERT INTO text_table (guidhigh, guid, data)

I ran ij from the command-line, and connected to one of the problematic
databases after killing the load.  Sure enough 1313 refers to the
primary key of text_table (there are no other indexes defined on this
table).  This is what is output:

CONGLOMERATENUMBER  |CONGLOMERATENAME

--------------------------------------------------------------------------------
---------------------------------------------------------------------
1313                |SQL080331145004520

This is the SQL we used to create this table:

CREATE TABLE text_table (guidhigh BIGINT NOT NULL,
                          guid BIGINT NOT NULL,
                          data BLOB (1G) NOT NULL,
                          PRIMARY KEY (guidhigh, guid))

What is interesting is if I perform a simple query on text_table, I get
the following:

ij> select count(*) from text_table;
ERROR XSDG2: Invalid checksum on Page Page(0,Container(0, 1313)),
expected=304,608,373, on-disk version=2,462,088,751, page dump follows:
Hex dump:
00000000: 0076 0000 0001 0000 0000 0000 27ea 0000  .v..............
00000010: 0000 0006 0000 0000 0000 0000 0000 0000  ................
00000020: 0000 0000 0001 0000 0000 0000 0000 0000  ................
....

Same as my application.  I have also noticed the connection is
automatically closed, as is the case in my application if I try and
perform another operation.

ij> select count(*) from text_table;
ERROR 08003: No current connection.

Reconnecting to the database has the same result.

So I guess it is not surprising now that conglomerate 1313 is always
returned since all worker processes create the same database on startup.
  However the corruption is always happening on page 0.  If we were
experiencing true disk problems, I'd expect the page number to be random
across the machines.

Any ideas on what to try next?

--
Cheers,
David

Nuix Pty Ltd
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Web: http://www.nuix.com                            Fax: [phone]

[Dyre Tjeldvoll]

David Sitsky <sits@...> writes:

> For what its worth, I did another run last night on my 6 quad-core
> system.  This time I had the derby issue happen for a JVM process on
> machine 1, two processes on machine 4, and one on machine 5.  I run
> four JVM processes per quad-core machine.
>
> All the JVM processes have roughly the same data processing rate, but
> the issue happens at different times into the load.  The problem
> occurred around time 420, 480, 800 and 900 minutes into the load for
> the four problematic processes.

Just to clarify: These jvm processes do not access the SAME database, do
they?

--
dt

[David Sitsky-2]

Dyre.Tjeldvoll@... wrote:

> David Sitsky <sits@...> writes:
>
>> For what its worth, I did another run last night on my 6 quad-core
>> system.  This time I had the derby issue happen for a JVM process on
>> machine 1, two processes on machine 4, and one on machine 5.  I run
>> four JVM processes per quad-core machine.
>>
>> All the JVM processes have roughly the same data processing rate, but
>> the issue happens at different times into the load.  The problem
>> occurred around time 420, 480, 800 and 900 minutes into the load for
>> the four problematic processes.
>
> Just to clarify: These jvm processes do not access the SAME database, do
> they?

No - they all have their own embedded derby database.

Cheers,
David

[Stanley Bradbury]

David Sitsky wrote:

> Hi Stanley,
>
>> The problem is happening on the Page 0 [the first page] of
>> conglomerate 1313 (the conglomerateId) - you can see what table/index
>> this corresponds to with the following query:
>>
>> select CONGLOMERATENUMBER, CONGLOMERATENAME
>>  from sys.sysconglomerates
>>  where conglomeratenumber =  1313;
>>
>>  From the errors in your log I suspect this to be the table or one of
>> the indexes of the failing query listed:
>>    INSERT INTO text_table (guidhigh, guid, data)
>
> I ran ij from the command-line, and connected to one of the
> problematic databases after killing the load.  Sure enough 1313 refers
> to the primary key of text_table (there are no other indexes defined
> on this table).  This is what is output:
>
> CONGLOMERATENUMBER  |CONGLOMERATENAME
>
> --------------------------------------------------------------------------------
>
> ---------------------------------------------------------------------
> 1313                |SQL080331145004520
>
> This is the SQL we used to create this table:
>
> CREATE TABLE text_table (guidhigh BIGINT NOT NULL,
>                          guid BIGINT NOT NULL,
>                          data BLOB (1G) NOT NULL,
>                          PRIMARY KEY (guidhigh, guid))
>
> What is interesting is if I perform a simple query on text_table, I
> get the following:
>
> ij> select count(*) from text_table;
> ERROR XSDG2: Invalid checksum on Page Page(0,Container(0, 1313)),
> expected=304,608,373, on-disk version=2,462,088,751, page dump
> follows: Hex dump:
> 00000000: 0076 0000 0001 0000 0000 0000 27ea 0000  .v..............
> 00000010: 0000 0006 0000 0000 0000 0000 0000 0000  ................
> 00000020: 0000 0000 0001 0000 0000 0000 0000 0000  ................
> ....
>
> Same as my application.  I have also noticed the connection is
> automatically closed, as is the case in my application if I try and
> perform another operation.
>
> ij> select count(*) from text_table;
> ERROR 08003: No current connection.
>
> Reconnecting to the database has the same result.
>
> So I guess it is not surprising now that conglomerate 1313 is always
> returned since all worker processes create the same database on
> startup.  However the corruption is always happening on page 0.  If we
> were experiencing true disk problems, I'd expect the page number to be
> random across the machines.
>
> Any ideas on what to try next?
>

Hi Dave -
The good news is that it looks like you do not have to recover this
database from backups because:
1)  since you can boot the database using IJ the corruption is not in
the transaction log (I assume you did not directly modify or delete any
files in the database directory tree in order to bypass recovery - *yes,
I have seen people do this*)
2) since the corruption is in an index you should be able to drop and
recreate the index thus restoring the index without any data loss.

I also have an idea that might get around it.  Since the problem is with
an index and during a data load (I am assuming the load is a one time
database initialization streaming lots of data?) then I would try
creating the index AFTER loading the data rather than declaring the
index in the table Create statement.  If the problem involves handling a
large number of database pages and the index pages at the same time
separating the activities will avoid it.  Doing this also insures that
index statistics are created (for more info on this see:  
http://wiki.apache.org/db-derby/CheckingForIndexStatistics)

As for the cause of the problem I can't be sure but since this happens
repeatedly and with different physical files it sounds like the problem
is not with the physical disk surface (I think the RAID architecture
helps protect against this type of failure anyway).

I'd like to see this problem captured in an JIRA entry.  You have
provided a lot of good information here and the results of performing a
load then creating the Primary Key will narrow it down more.  My
gut-level feel is that reproducing this will be hard without an
environment similar to yours.  With the multiple processors and the RAID
array I imagine it is a pretty fast machine and this may be exposing a
thread synchronization issue in Derby (or not).  Having your information
and stack traces may give the stores folks enough information to perform
a code inspection for this or other issues.  Would you file a JIRA
describing your processing, the machine environment, the JVM and attach
your derby log files?  

[David Sitsky-2]

> Hi Dave -
> The good news is that it looks like you do not have to recover this
> database from backups because:
> 1)  since you can boot the database using IJ the corruption is not in
> the transaction log (I assume you did not directly modify or delete any
> files in the database directory tree in order to bypass recovery - *yes,
> I have seen people do this*)

Correct.

> 2) since the corruption is in an index you should be able to drop and
> recreate the index thus restoring the index without any data loss.
>
> I also have an idea that might get around it.  Since the problem is with
> an index and during a data load (I am assuming the load is a one time
> database initialization streaming lots of data?) then I would try

Yes.

> creating the index AFTER loading the data rather than declaring the
> index in the table Create statement.  If the problem involves handling a
> large number of database pages and the index pages at the same time
> separating the activities will avoid it.  Doing this also insures that
> index statistics are created (for more info on this see:  
> http://wiki.apache.org/db-derby/CheckingForIndexStatistics)

Ok - we are restructuring the application, so that now, we can get away
with a primary key field of just an INTEGER, rather than the two BIGINT
columns.  Also, because of the restructure, we don't need to check for
the existence of a duplicate record before insertion, so we can now
create the primary key once all of the data has been loaded.

I'm in the process of merging these changes in, and will try to do some
more big loads to see if this has made the problem go away.  I'll let
you know how I go in the next few days.

> As for the cause of the problem I can't be sure but since this happens
> repeatedly and with different physical files it sounds like the problem
> is not with the physical disk surface (I think the RAID architecture
> helps protect against this type of failure anyway).

For these tests - I am just running software "scary raid" (raid-0), but
the OS doesn't report any disk failures.

> I'd like to see this problem captured in an JIRA entry.  You have
> provided a lot of good information here and the results of performing a
> load then creating the Primary Key will narrow it down more.  My
> gut-level feel is that reproducing this will be hard without an
> environment similar to yours.  With the multiple processors and the RAID
> array I imagine it is a pretty fast machine and this may be exposing a
> thread synchronization issue in Derby (or not).  Having your information
> and stack traces may give the stores folks enough information to perform
> a code inspection for this or other issues.  Would you file a JIRA
> describing your processing, the machine environment, the JVM and attach
> your derby log files?

Will do - once I have more information from the load with the modified
application, I'll create the JIRA entry with all the relevant information.

Thanks so much for your advice.

--
Cheers,
David

Nuix Pty Ltd
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Web: http://www.nuix.com                            Fax: [phone]

[David Sitsky-2]

> Ok - we are restructuring the application, so that now, we can get away
> with a primary key field of just an INTEGER, rather than the two BIGINT
> columns.  Also, because of the restructure, we don't need to check for
> the existence of a duplicate record before insertion, so we can now
> create the primary key once all of the data has been loaded.

As expected, our loading doesn't exhibit the problem now with the above
change.

Incidentally, we had a customer being hit with this problem yesterday,
on their own hardware, which was an AMD64 dual core 4200 with 4 GB of
ram running 32 bit XP pro.

I will create the JIRA entry in the next day or two - the fact this has
now been seen on an external site on completely different hardware / OS
shows we are probably dealing with a software issue.

--
Cheers,
David

Nuix Pty Ltd
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[Stanley Bradbury]

David Sitsky wrote:

>> Ok - we are restructuring the application, so that now, we can get
>> away with a primary key field of just an INTEGER, rather than the two
>> BIGINT columns.  Also, because of the restructure, we don't need to
>> check for the existence of a duplicate record before insertion, so we
>> can now create the primary key once all of the data has been loaded.
>
> As expected, our loading doesn't exhibit the problem now with the
> above change.
>
> Incidentally, we had a customer being hit with this problem yesterday,
> on their own hardware, which was an AMD64 dual core 4200 with 4 GB of
> ram running 32 bit XP pro.
>
> I will create the JIRA entry in the next day or two - the fact this
> has now been seen on an external site on completely different hardware
> / OS shows we are probably dealing with a software issue.
>

Thanks for thorough job in reporting this problem.